pyOPALTools Documentation

pyOPALTools

• amr package
  • amr.AmrOpal module
    • AmrOpal
      • AmrOpal.__init__()
      • AmrOpal.line_plot()
      • AmrOpal.load_file()
      • AmrOpal.particle_phase_space_plot()
      • AmrOpal.particle_plot()
      • AmrOpal.projection_plot()
      • AmrOpal.slice_plot()
• db package
  • db.mldb module
    • buildBounded()
    • checkBounds()
    • findClosestIndex()
    • mldb
      • mldb.__init__()
      • mldb.build()
      • mldb.buildASCII()
      • mldb.buildFromSDDS()
      • mldb.buildFromSampler()
      • mldb.getAllDvar()
      • mldb.getAllDvarData()
      • mldb.getAllObj()
      • mldb.getAllObjData()
      • mldb.getBounds()
      • mldb.getDVarVec()
      • mldb.getDvarsPD()
      • mldb.getNumberOfSamples()
      • mldb.getObjVec()
      • mldb.getQoIsPD()
      • mldb.getQoiDvarPD()
      • mldb.getSampleSize()
      • mldb.getTimes()
      • mldb.getXDim()
      • mldb.getXNames()
      • mldb.getYDim()
      • mldb.getYNames()
      • mldb.load()
      • mldb.printOverview()
      • mldb.writeDB()
    • strToFloat()
    • substring_after()
    • substring_before()
• jobhandler package
  • jobhandler.submit module
    • JobSubmitter
      • JobSubmitter.__init__()
      • JobSubmitter._write_run_file()
      • JobSubmitter.submit()
• opal package
  • Subpackages
    • opal.analysis package
      • Notebooks
      • opal.analysis.FieldAnalysis module
      • opal.analysis.H5Statistics module
      • opal.analysis.OptimizerAnalysis module
      • opal.analysis.SamplerStatistics module
      • opal.analysis.Statistics module
      • opal.analysis.StdOpalOutputAnalysis module
      • opal.analysis.TrackOrbitAnalysis module
      • opal.analysis.cyclotron module
      • opal.analysis.pareto_fronts module
    • opal.datasets package
      • Notebooks
      • opal.datasets.AmrDataset module
      • opal.datasets.DatasetBase module
      • opal.datasets.FieldDataset module
      • opal.datasets.GridDataset module
      • opal.datasets.H5Dataset module
      • opal.datasets.LBalDataset module
      • opal.datasets.LossDataset module
      • opal.datasets.MemoryDataset module
      • opal.datasets.OptimizerDataset module
      • opal.datasets.PeakDataset module
      • opal.datasets.ProbeHistDataset module
      • opal.datasets.SDDSDatasetBase module
      • opal.datasets.SamplerDataset module
      • opal.datasets.SolverDataset module
      • opal.datasets.StatDataset module
      • opal.datasets.StdOpalOutputDataset module
      • opal.datasets.TimeDataset module
      • opal.datasets.TrackOrbitDataset module
      • opal.datasets.filetype module
    • opal.parser package
      • Notebooks
      • opal.parser.FieldParser module
      • opal.parser.H5Error module
      • opal.parser.H5Parser module
      • opal.parser.HistogramParser module
      • opal.parser.LatticeParser module
      • opal.parser.LossParser module
      • opal.parser.OptimizerParser module
      • opal.parser.PeakParser module
      • opal.parser.SDDSParser module
      • opal.parser.TimingParser module
      • opal.parser.TrackOrbitParser module
      • opal.parser.sampler module
    • opal.utilities package
      • Notebooks
      • opal.utilities.logger module
      • opal.utilities.wrapper module
    • opal.visualization package
      • Subpackages
      • Notebooks
      • opal.visualization.AmrPlotter module
      • opal.visualization.BasePlotter module
      • opal.visualization.FieldPlotter module
      • opal.visualization.GridPlotter module
      • opal.visualization.H5Plotter module
      • opal.visualization.MemoryPlotter module
      • opal.visualization.OptimizerPlotter module
      • opal.visualization.PeakPlotter module
      • opal.visualization.ProbePlotter module
      • opal.visualization.ProfilingPlotter module
      • opal.visualization.SamplerPlotter module
      • opal.visualization.SolverPlotter module
      • opal.visualization.StatPlotter module
      • opal.visualization.StdOpalOutputPlotter module
      • opal.visualization.TimingPlotter module
      • opal.visualization.TrackOrbitPlotter module
      • opal.visualization.formatter module
  • opal.config module
  • opal.opal module
    • _append_dataset()
    • load_dataset()
• optPilot package
  • optPilot.Annotate module
    • AnnoteFinder
      • AnnoteFinder.__init__()
      • AnnoteFinder.drawAnnote()
      • AnnoteFinder.drawSpecificAnnote()
      • AnnoteFinder.getAnchor()
      • AnnoteFinder.listifyData()
    • distance()
  • optPilot.Interpolator module
    • Interpolator
      • Interpolator.__init__()
      • Interpolator.evaluate()
      • Interpolator.train()
  • optPilot.visualize module
    • OptData
      • OptData.__init__()
      • OptData.getX()
      • OptData.getY()
      • OptData.get_variables()
      • OptData.readData()
      • OptData.readInitialData()
    • Plotter
      • Plotter.__init__()
      • Plotter.add_reset()
      • Plotter.add_slider()
      • Plotter.plot()
      • Plotter.setupPlot()
    • computeLimits()
    • getXY()
    • improveName()
    • main()
    • readJSONData()
  • optPilot.visualize_parallel_coords module
    • find()
    • natural_sort()
    • plot_parcoords()
    • sort_list()
  • optPilot.visualize_pf module
    • computeLimits()
    • improveName()
    • main()
    • onpick()
    • plot()
    • readDAT_0()
    • readData()
    • readJSONData()
    • saveVideo()
    • setupPlot()
• pc package
  • pc.pce module
    • getPCData()
    • pceEval
      • pceEval.__init__()
      • pceEval.evalPc()
• setup module
• surrogate package
  • Notebooks
    • Example 1 (using Chaospy (3.0.5))
    • Example: Ishigami function (using Chaospy (3.0.5))
  • surrogate.bootstrap.bootstrap module
    • bootstrap_ci()
    • bootstrap_sobol()
  • surrogate.chaospy_model module
  • surrogate.uqtk_model module